Beschrijving van de attractie
Het klooster werd in 1280 gesticht door Donna Mora Dias voor Clarissiaanse nonnen. Het klooster hield niet lang stand en hield in 1311 op te bestaan. In 1316 herbouwde de vrouw van koning Dinis I, koningin Isabella van Portugal, het klooster.
Koningin Isabella van Portugal werd ook wel de "Heilige Koningin" genoemd vanwege haar uitzonderlijke vroomheid en rechtschapenheid. De koningin was ook beroemd om haar vriendelijke karakter, stichtte ziekenhuizen, weeshuizen en scholen. Na de dood van haar man, koning Dinish, trok ze zich terug in dit klooster. En in 1336 stierf de koningin en werd begraven in een klooster in een in gotische stijl versierde tombe. In 1626 werd koningin Isabella heilig verklaard vanwege haar barmhartigheid en goede daden.
De eerste architect van het klooster was Domingos Dominguez, beroemd om zijn werk aan de galerijen van het klooster van Alcobas. Hij zette het werk voort van deze architect Estevao Dominguez, die beroemd werd door zijn werk aan de galerijen van de kathedraal in Lissabon. In 1330 vond de inwijding van de tempel plaats en even later werd aan het zuidelijke deel van de kerk een klooster toegevoegd. Geldelijke donaties en geschenken werden vaak aan het klooster aangeboden. Aan het begin van de 16e eeuw werd de kerk versierd met Sevilla-tegels en werden er nieuwe altaren geïnstalleerd.
Sinds het klooster en de kerk op de linkeroever van de rivier de Mondego werden gebouwd, kwamen de gebouwen een jaar later onder water te staan door het overstromende rivierwater. En in de loop van enkele eeuwen werd het klooster vele malen overstroomd. Vanwege frequente overstromingen was het onmogelijk om in het klooster te blijven, en koning Jan IV beval het gebouw te verlaten en naar een nieuw klooster te verhuizen - het klooster van Santa Clara-a-Nova, gebouwd op een heuvel niet ver van het oude gebouw. Het graf met de as van koningin Isabella en andere koninklijke figuren is verplaatst naar een nieuw gebouw.
Na verloop van tijd veranderde het oude klooster in ruïnes. In 1910 werd het gebouw opgenomen in de lijst van monumenten van nationaal belang en in de eerste helft van de 20e eeuw werden enkele verbouwingswerken uitgevoerd.